In den Jahren 1991 – 1992 kamen die ersten jüdischen Emigranten aus der ehemaligen UdSSR nach Rostock. Ende November 1992 gründeten 27 dieser Emigranten die Jüdische Landesgemeinde Mecklenburg-Vorpommern.

1992 – 1993 kamen jüdische Emigranten auch nach Wismar und Schwerin. Am 24.04.1994 wurde die Landesgemeinde in die Gemeinden Rostock und Schwerin geteilt, die heute den Landesverband der jüdischen Gemeinden in Mecklenburg-Vorpommern bilden.

Die neu gegründete Jüdische Gemeinde Rostock ist die Nachfolgerin der Jüdischen Gemeinde Rostock, die bis zum II. Weltkrieg existierte. Diejenigen Mitglieder, die es nicht schafften, rechtzeitig zu emigrieren, wurden entweder deportiert oder aber von den Nazis vernichtet – in Rostock gab es keine Juden mehr.

1996 bezog die Rostocker Gemeinde dank der Hilfe des Zentralrates der Juden in Deutschland und der Stadtverwaltung der Hansestadt Rostock das Haus am Wilhelm-Külz-Platz 6. Gleichzeitig konnte eine Fläche für den damals einzigen offenen jüdischen Friedhof in Mecklenburg-Vorpommern auf dem städtischen Westfriedhof bereitgestellt werden.

Einer der wichtigsten Schritte für die Gemeinde war die Unterzeichnung einer nicht nur für ostdeutsche Gemeinden beispielhaften gemeinsamen Erklärung über die Zusammenarbeit im Rahmen einer Arbeitskommission mit der Hansestadt Rostock am 8.11.1998 anläßlich der Woche der Erinnerung an die „Reichspogromnacht“ am 9./10.11.1938.

Die geistige Geburt der Gemeinde wurde mit dem Einzug der Thorarolle zu Simchat Thora 1998 gefeiert. Die Leihgabe der Jüdischen Gemeinde Aachen ermöglichte nunmehr die Durchführung vollwertiger Gottesdienste, da von den ursprünglichen Rostocker Thorarollen keine mehr zu verwenden ist.

In den vergangenen 15 Jahren ist die Gemeinde Rostock um mehr als das Zehnfache gewachsen und hat heute knapp 700 Mitglieder. Damit ist die Gemeinde heute größer als die Vorkriegsgemeinde. Zusammen mit den nichtjüdischen Familienangehörigen beträgt die Anzahl der vor allem im sozialen Bereich zu betreuenden Personen ca. 1400.

Aber die Gemeinde ist nicht nur zahlenmäßig gewachsen, sie ist stärker geworden und hat sich zu einer Organisation gewandelt, die Autorität und Anerkennung in der Öffentlichkeit genießt und sich bemüht, ihrer Verantwortung für eine tolerante und weltoffenen Bürgergesellschaft in der Hansestadt Rostock gerecht zu werden.

Das Leben in der Gemeinde gestaltet sich heute äußerst vielschichtig und verlangt von dem durch die Repräsentantenversammlung, dem höchsten Organ der Jüdischen Gemeinde Rostock, gewählten Vorstand tagtäglich neue Entscheidungen ab. Hauptaugenmerk richtet der Vorstand dabei auf die Schaffung eines vollwertigen religiösen Lebens für alle Mitglieder.

Zu den Gemeindediensten zählen neben der Sozialbetreuung auch die Gemeindebibliothek, die Sonntagsschule für Kinder, ein Jugendklub, ein Frauenklub, ein Seniorenklub sowie ein Musik- und Kunstzirkel.

2004 beging die Gemeinde ihr zehnjähriges Bestehen und zog in ihr neues Gemeindezentrum in die Augustenstrasse 20, das sich nur wenige Meter entfernt von dem Standort der alten Synagoge (1902 – 1938) in der Augustenstraße 101 befindet.

Diesem Umstand misst der derzeitige Gemeindevorsitzende Juri Rosov ganz besondere Bedeutung bei. Es zeige, dass die Mitglieder der heutigen Jüdischen Gemeinde Rostock keine Fremden seien, sondern sich als Nachfolger der ehemaligen jüdischen Gemeinde verstehen, die mit der Deportation der letzten jüdischen Einwohner Rostocks im Jahre 1943 aufhörte zu existieren.

Die Gemeinde ist Mitglied im Landesverband Jüdischer Gemeinden in Mecklenburg-Vorpommern, in der Bürgerinitiative „Bunt statt braun“. Sie kooperiert mit dem Zentralrat der Juden in Deutschland, mit der Zentralwohlfahrtsstelle der Juden in Deutschland, dem Theater „Mechaje – Jüdisches Theater in M-V“, dem „Jüdischen Turn- und Sportverein Makkabi Rostock e.V.“. Durch ihre vielen sozialen und kulturellen Aktivitäten ist die Gemeinde in den letzten Jahren zu einem wichtigen Bestandteil des Netzwerkes für Migranten in der Hansestadt Rostock geworden. Als Projektträger arbeitete und arbeitet die Gemeinde außerdem auch mit verschiedenen Ämtern der Hansestadt Rostock, mit der ARGE Rostock sowie der RAA Mecklenburg-Vorpommern zusammen.